虽然人工流产只是一般所谓的小手术，但并非简单的手术。粗暴或不正确的操作往往招来严重的后遗症：
　　1、子宫穿孔：妊娠周数愈大，火急机率愈高；流产次数愈多，穿孔机会也愈大。其它如子宫地位、形状异常或以前动过手术的子宫（如剖腹产或肌瘤切除）皆有较大的穿孔机会。
　　2、子宫颈或内膜粘黏：在进行子宫扩刮术时，如果刮的太粗野，导致子宫颈或内膜受伤、发炎，就有大约产生术后的子宫颈或内膜粘黏、并会引起月经异常，如无月经或月经量过少。严重者会在今后产生不育症的消息。
　　3、不健全流产：如果手术施行不健全，少量胎儿描绘残留于子宫内，大约相关子宫收小而设立持续出血或设立粘黏、打动等消息。**再仔细做一次手术去根残余的描绘。子宫的地位或形状不健康，平时比较简单设立之后遗症。
　　4、带菌打动：如果器械消毒不健全，或是手术者本身未关怀无菌过程，即大约设立子宫内打动，甚至继续往上传染侵略输卵管及骨盆腔，严重时会设立今后简单宫外孕或不孕的效果。
　　5、子宫颈受伤：在扩张子宫颈口的过程，如果不在心，或扩张速度太快，都有大约设立子宫颈的伤害，并设立今后怀孕较简单流产的情状，尤其是**次怀孕或尚未生育过的妇女比较简单出现。
　　6、实行麻醉时可能造成吸入性肺炎或呼吸停止的状况。
　　7、口服药物流产需注意有可能大量出血及不完全流产的问题。