卵巢囊肿可以导致女性不孕。下面根据不同的囊肿作具体分析：

　　1、巧克力囊肿(子宫内膜异位瘤)，是指子宫内膜异位症长在卵巢内，在卵巢内形成大量黏稠咖啡色像巧克力状的液体。因为子宫内膜异位瘤会随着时间增加而变大，渐渐侵蚀正常的组织，造成卵巢组织不可逆的损害。经过评估其严重性后，可能需要开刀处理。

　　2、出血性囊肿，有时滤泡囊肿及黄体囊肿生长过速，造成卵巢的组织牵扯而裂开流血。这些血液因没有出口出去而积在卵巢里，就称为出血性囊肿。这种囊肿一般会自行消失但所需时间较长。如果身体不适的现象较为明显，则可服药减缓症状。只有在少数的情况下，病人呈现较严重症状时才需要开刀切除。

　　3、畸胎瘤，这是一种很特别的囊肿，可能是在胚胎时期的细胞分化上出了问题，经过很久的时间才表现出来。它会在卵巢内生成毛发、牙齿还有一些油脂类的聚集。由于畸胎瘤本身不会自行消失，而且还有可能不断的成长，另有15%机率会造成卵巢扭转，所以好及早切除。一般来说恶性的比率小于千分之一。

　　4、卵巢癌，罹患卵巢癌的机率相当低，但因为位于骨盆腔内，并不容易早期发现。